3ª Fase de construção-1786-1802

Sob a direção do sargento-mor Manuel Caetano de Sousa (1738-1802), nomeado Arquiteto da Casa do Infantado em 1785, terão lugar as últimas obras na Real Quinta de Queluz:

- Ampliação do 1º andar, iniciado em 1784, desde a Sala dos Embaixadores até à Sala do Café, para servir de aposentos a D. João e D. Carlota Joaquina - 1784-1789

- Construção do Pavilhão D. Maria, para servir de aposentos ao herdeiro da coroa, D. José, Príncipe do Brasil. Para a construção da nova ala, foi necessário demolir a Casa da Ópera construída 10 anos antes. 1784-1789

Já sob a administração de D. João, deu-se início à construção dos edifícios na envolvente e fronteiros ao Palácio, integrado no projeto inacabado de ampliação da área edificada, a “Vila do Príncipe da Beira”:

- Construção do edifício da Torre do Relógio, destinado a mantearia e acomodações do pessoal do paço

- Construção do Quartel de Soldados de Cavalaria edifício, para servir de alojamento às cavalariças e cocheiras da Casa Real e à Guarda do Palácio, onde atualmente se localiza o Quartel do Regimento de Artilharia Antiaérea Nº 1